様々なマップを簡単に作成
簡単操作で解析時間の短縮に
Optical Mappingデータ解析ソフトウェア
BV Workbench
膜電位イメージング / カルシウムイメージング用解析ソフトウェア
BV Workbenchは、膜電位感受性色素（Voltage sensitive dye）やカルシウム色素で染色された脳や心臓を用いたoptical mapping用のデータ解析ソフトウェアの最新バージョンです。
ブレインビジョン製 MiCAMイメージング システムで取得したデータ ファイルに加えて、他社のカメラシステムで取得した 16ビット TIFF ファイルをインポートすることも可能です。
前バージョンと比較して、本バージョンでは心臓解析、各種マップ表示、画像エクスポートなどの機能が大幅に向上。このソフトウェアを使用すると、科学論文用の高精度の出力データを迅速に作成することができます。
心臓イメージング / 神経イメージングアプリケーション
以下の動物サンプルと蛍光プローブを使用した心臓および神経データ解析に適しています。
心臓サンプル
- ランゲンドルフ灌流心臓
- 心臓スライス
- 培養心筋細胞
神経サンプル
- In Vivo脳
- 脳スライス
- 培養神経細胞
蛍光ブローブなど
- Di-4-ANEPPSやFluoVoltなどの膜電位感受性蛍光色素
- Fluo-4やCal520などのカルシウム感受性蛍光色素
- GECI、GEVI、FRETなどの蛍光タンパク質
- ヘモグロビンとフラビン蛍光タンパク由来の内因性信号
主な特長
- 様々なマップ画像を作成可能
- 科学論文やプレゼンテーションで使用する高解像度画像を簡単に出力
- 直感的で簡単な操作、分析時間の短縮
- ピーク検出と最適値設定を自動で行うことが可能
- 他社製システムからエクスポートされた 16ビット TIFFファイルを読み込むことも可能
- 電子メールによる技術サポート
特長
メインウインドウ
解析ウインドウ
さまざまな実験用途に対応した画像解析・マップ作成機能
作成可能なマップの一覧
- Activation map / half rise map
- Repolarization map / half decay map
- APD map / CaTD map
- Phase map / Phase singularity / PS trajectory
- Conduction velocity map
- Dominant frequency map
- Amplitude alternans map
- APD alternans map
- Maximum upstroke velocity map
- Diastolic interval map
- Decay τ (tau) map
- Rise time map
- Peak time map
- Peak amplitude map
- Peak to repolarization time map / Peak to half decay time map
- Peak interval map
波形解析
論文、ポスター、スライド用の図を素早く作成するための画像エクスポート
画像は「PNG」形式または「SVG」形式で出力できます。
「PNG」形式は、画質を劣化させずに高精細な印刷に適しています。
「SVG」（Scalable Vector Graphics）は、Adobe Illustrator、Inkscapeなどのベクターグラフィックスソフトウェアを使用して簡単に修正できます。
自動ピーク検出、フィルター/マップの最適値設定
一部の機能は、ユーザーが指定しなくても最適な値が設定されるように設計されています（ユーザーが手動で値を変更することも可能）。
S/N比を向上させる各種ノイズ低減フィルターとデータ補正
| Illumination correction | 明るさ補正・照度ムラ補正 |
|---|---|
| Distortion correction | レンズの歪みの補正 |
| Gaussian filter | ガウスフィルターによるノイズ除去 |
| Mean filter | ミーンフィルターによるノイズ除去 |
| Median filter | メディアンフィルターによるノイズ除去 |
| Drift removal | 蛍光退色カーブの補正 |
| Invert | 画像と波形の極性を反転する |
| Dynamic range optimization | 各ピクセルの光強度値を最適化し、16ビット階調を最大限に活用することで、暗い画像を明るくする |
| Normalization | ピクセル間の光強度の振幅の違いを補正し、すべてのピクセルの光強度値が同じ振幅になるように計算 (0 ～ 65,535) |
| FIR filter | FIR(Finite Impulse Response)フィルターによるノイズ除去 |
| Moving average | 移動平均フィルタによるノイズ除去 |
| Savitzky-Golay | NSavitzky-Golayフィルターによるノイズ除去 |
| Alignment | 2枚の画像を拡大・縮小・回転・移動して重ね合わせる |
| Binning | 複数のピクセルを1つのピクセルに結合 (加算または平均) |
| Average datasets | 複数のデータセットからのデータをオフラインで平均化する |
| Crop | 範囲を指定して画像を切り抜く |
| Deinterleave frames | GCaMPやFura-2などの多波長励起イメージングで取得したデータのフレームを抽出し、複数のデータに分割 |
| Frame operation | 同じデータセット内の 2 つのデータ間の加算/減算/乗算/除算 |
| Create subset | 時間範囲を指定して別データとして開く |
年に数回のソフトウェアアップデート
継続的に新機能を追加し、バグを修正します (リリース日はランダム)
Eメールによる技術サポート
ソフトウェアの使用方法またはデータ分析についてご質問がある場合は、いつでもメールでお問い合わせいただけます。
仕様
サポートしているデータ形式
| インポート | RAW | 本ソフト専用フォーマット |
|---|---|---|
| TIFF | 一般的な 16 ビット グレースケール tiff ファイル | |
| GSD | Brainvision製のソフトウェア BV_Ana のフォーマット | |
| エクスポート | PNG | 画像データ、マップデータ（高解像度） |
| SVG | 画像データ、地図データ（ベクター画像） | |
| TIFF | 画像データ（実解像度） | |
| CSV | 画像データ、波形データ | |
| Parquet | 波形データ | |
| AVI | 動画データ |
ソフトウェア要件
| ソフトウェア | OS: Windows 7 またはそれ以降のバージョン (64 bit). |
|---|---|
| ハードウェア | 採用 - Any Intel or AMD x86-64 processor - 8 GBのRAM - インストール用に 400 MB のディスク容量 推奨 - 4 つの論理コアと AVX2 命令セットを備えた Intel または AMD x86-64 プロセッサ 。 - 32 GBのRAM - NVMe Solid-state drive - NVIDIA GPU |
サンプル動画
Activationマップ
Action potential duration (APD) マップ
ダウンロード
ソフトウェアライセンス
BV Workbench を使用するには、専用ライセンスでアクティベートする必要があります (有料)。 ライセンスは各コンピュータに固有のハードウェア ID を使用してコンピュータごとに発行されます。 あるコンピュータに対して発行されたライセンスを使用して、別のコンピュータを認証することはできません。 ライセンスの取得および設定方法については、弊社までお問い合わせください。
お試しライセンス
BV Workbench用の3か月 無料トライアルライセンスを発行します。 まずはお問い合わせください。 下記の「お問い合わせ」ボタンをクリックしてお問い合わせフォームにお進みください。
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